On a observé durant 6 campagnes d’observation du milieu marin menées depuis 22 ans en plusieurs sites du canyon grâce à un robot sous-marin :
Ces études permettent de conclure à une absence d’impact notable des résidus sur la macrofaune benthique (animaux aquatiques) y compris à forte profondeur.
Pour sa part, l’Agence des Aires Marines Protégées a réalisé en 2013 des campagnes d’observation dans les canyons profonds de Méditerranée. Le canyon de Cassidaigne fait partie des sites les plus exceptionnels de la façade méditerranéenne française par l’exubérance des espèces et l’abondance des coraux blancs.